Žilinka ellen az a vád merült fel, hogy akadályozta az ellenzéki vizsgálat lefolytatását a Főügyészségen.

Branislav Vančo, a Progresszív Szlovákia (PS) politikai képviselője arra hívta fel a figyelmet, hogy Maroš Žilinka főügyész kísérletet tett a hétfőn esedékes képviselői vizsgálat meghiúsítására. Ez a vizsgálat a Speciális Ügyészség megszüntetésének folyamatára összpontosított.
Vančo kifejtette, hogy Žilinka megakadályozta a képviselők kommunikációját a Főügyészség súlyos bűncselekményekkel foglalkozó osztályának ügyészeivel, továbbá a korábbi Speciális Ügyészség ügyészeivel is. Ennek következtében a képviselő úgy döntött, hogy meghívja őket a parlamenti ülésekre, hogy lehetőséget biztosítson a közvetlen párbeszédre.
A PS képviselőjének nyilatkozata szerint a főügyész kifejezte elégedetlenségét amiatt, hogy a megbeszélés nem konkrét ügyekre összpontosít. "Amikor azonban egy konkrét esetre tereltem a szót, amely a maffia vagyonának visszaszolgáltatásával kapcsolatos, nem volt hajlandó válaszolni" - tette hozzá.
A képviselő kifejtette, hogy a vizsgálat megindításának indoka az a meggyőződése, miszerint a Speciális Ügyészség megszüntetésének folyamata rendkívül átláthatatlan. Továbbá olyan értesülésekhez jutott, amelyek arra utalnak, hogy a Speciális Ügyészség ügyészeinek áthelyezése nem megfelelően lett megszervezve, ami káoszt eredményezett.
Ondrej Dostál, az SaS képviselője és a parlament alkotmányjogi bizottságának tagja úgy fogalmazott, Žilinka nem engedte, hogy a vizsgálat során az ügyészség belső kritikusait meghallgassák.
Žilinka határozottan elutasította a felvetést, hangsúlyozva, hogy nem kíván teret adni az efféle "politikai játszmáknak". A főügyész egy rövid sajtótájékoztatót hívott össze, ám a jelenlévők kérdéseire nem reagált.
Szerinte az ellenzék által megjelölt vizsgálati cél "zavaros és végrehajthatatlan" volt, mivel azt állították, hogy a törvények betartását és alkalmazását akarják ellenőrizni. Žilinka hozzátette, ha az ügyészek politikusokkal beszélgetnének, azáltal megkérdőjelezhetővé válna a pártatlanságuk. Azt is állította, hogy maga a súlyos bűncselekményekkel foglalkozó osztály ügyészei sem akartak találkozni a képviselőkkel.